Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lamc3Q9R0B6 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Lamc3Q9R0B6 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lamc3Q9R0B6 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lamc3Q9R0B6 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Lamc3Q9R0B6 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lamc3Q9R0B6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lamc3Q9R0B6 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lamc3Q9R0B6 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lamc3Q9R0B6 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lamc3Q9R0B6 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lamc3Q9R0B6 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lamc3Q9R0B6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lamc3Q9R0B6 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lamc3Q9R0B6 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Lamc3Q9R0B6 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Lamc3Q9R0B6 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Lamc3Q9R0B6 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lamc3Q9R0B6 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Lamc3Q9R0B6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lamc3Q9R0B6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lamc3Q9R0B6 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lamc3Q9R0B6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lamc3Q9R0B6 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lamc3Q9R0B6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lamc3Q9R0B6 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Lamc3Q9R0B6 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lamc3Q9R0B6 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lamc3Q9R0B6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lamc3Q9R0B6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lamc3Q9R0B6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lamc3Q9R0B6 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lamc3Q9R0B6 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lamc3Q9R0B6 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Lamc3Q9R0B6 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Lamc3Q9R0B6 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Lamc3Q9R0B6 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lamc3Q9R0B6 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lamc3Q9R0B6 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lamc3Q9R0B6 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lamc3Q9R0B6 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lamc3Q9R0B6 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lamc3Q9R0B6 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lamc3Q9R0B6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lamc3Q9R0B6 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lamc3Q9R0B6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lamc3Q9R0B6 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lamc3Q9R0B6 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lamc3Q9R0B6 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lamc3Q9R0B6 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lamc3Q9R0B6 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lamc3Q9R0B6 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lamc3Q9R0B6 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lamc3Q9R0B6 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Lamc3Q9R0B6 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Lamc3Q9R0B6 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lamc3Q9R0B6 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Lamc3Q9R0B6 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lamc3Q9R0B6 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lamc3Q9R0B6 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lamc3Q9R0B6 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lamc3Q9R0B6 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lamc3Q9R0B6 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Lamc3Q9R0B6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lamc3Q9R0B6 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lamc3Q9R0B6 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lamc3Q9R0B6 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lamc3Q9R0B6 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lamc3Q9R0B6 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lamc3Q9R0B6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lamc3Q9R0B6 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lamc3Q9R0B6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lamc3Q9R0B6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lamc3Q9R0B6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Lamc3Q9R0B6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lamc3Q9R0B6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lamc3Q9R0B6 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lamc3Q9R0B6 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lamc3Q9R0B6 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lamc3Q9R0B6 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lamc3Q9R0B6 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Lamc3Q9R0B6 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lamc3Q9R0B6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lamc3Q9R0B6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lamc3Q9R0B6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lamc3Q9R0B6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lamc3Q9R0B6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lamc3Q9R0B6 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lamc3Q9R0B6 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lamc3Q9R0B6 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lamc3Q9R0B6 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lamc3Q9R0B6 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lamc3Q9R0B6 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Lamc3Q9R0B6 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Lamc3Q9R0B6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lamc3Q9R0B6 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lamc3Q9R0B6 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lamc3Q9R0B6 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lamc3Q9R0B6 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lamc3Q9R0B6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms