Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

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Length 854 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Sh2d3cQ9QZS8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Sh2d3cQ9QZS8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Sh2d3cQ9QZS8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Sh2d3cQ9QZS8 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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