Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Rnf4Q9QZS2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Rnf4Q9QZS2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Rnf4Q9QZS2 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf4Q9QZS2 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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