Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms