Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

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Length 1,682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Col4a4Q9QZR9 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Col4a4Q9QZR9 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
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Col4a4Q9QZR9 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Col4a4Q9QZR9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Col4a4Q9QZR9 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Col4a4Q9QZR9 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Col4a4Q9QZR9 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Col4a4Q9QZR9 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Col4a4Q9QZR9 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Col4a4Q9QZR9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms