Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms