Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms