Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY39

Pdzd4, PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd4Q9QY39 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms