Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms