Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms