Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms