Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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