Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMA7

Cyp3a41a, Cytochrome P450 3A41, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp3a41aQ9JMA7 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cyp3a41aQ9JMA7 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cyp3a41aQ9JMA7 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cyp3a41aQ9JMA7 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cyp3a41aQ9JMA7 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cyp3a41aQ9JMA7 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cyp3a41aQ9JMA7 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cyp3a41aQ9JMA7 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cyp3a41aQ9JMA7 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cyp3a41aQ9JMA7 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cyp3a41aQ9JMA7 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cyp3a41aQ9JMA7 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cyp3a41aQ9JMA7 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cyp3a41aQ9JMA7 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cyp3a41aQ9JMA7 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cyp3a41aQ9JMA7 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cyp3a41aQ9JMA7 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cyp3a41aQ9JMA7 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cyp3a41aQ9JMA7 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Cyp3a41aQ9JMA7 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cyp3a41aQ9JMA7 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cyp3a41aQ9JMA7 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cyp3a41aQ9JMA7 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cyp3a41aQ9JMA7 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cyp3a41aQ9JMA7 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cyp3a41aQ9JMA7 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cyp3a41aQ9JMA7 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cyp3a41aQ9JMA7 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cyp3a41aQ9JMA7 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cyp3a41aQ9JMA7 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cyp3a41aQ9JMA7 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cyp3a41aQ9JMA7 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cyp3a41aQ9JMA7 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cyp3a41aQ9JMA7 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cyp3a41aQ9JMA7 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cyp3a41aQ9JMA7 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cyp3a41aQ9JMA7 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cyp3a41aQ9JMA7 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cyp3a41aQ9JMA7 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cyp3a41aQ9JMA7 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cyp3a41aQ9JMA7 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cyp3a41aQ9JMA7 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cyp3a41aQ9JMA7 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cyp3a41aQ9JMA7 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cyp3a41aQ9JMA7 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cyp3a41aQ9JMA7 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cyp3a41aQ9JMA7 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cyp3a41aQ9JMA7 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cyp3a41aQ9JMA7 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cyp3a41aQ9JMA7 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cyp3a41aQ9JMA7 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cyp3a41aQ9JMA7 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cyp3a41aQ9JMA7 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cyp3a41aQ9JMA7 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cyp3a41aQ9JMA7 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cyp3a41aQ9JMA7 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cyp3a41aQ9JMA7 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cyp3a41aQ9JMA7 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cyp3a41aQ9JMA7 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cyp3a41aQ9JMA7 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cyp3a41aQ9JMA7 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cyp3a41aQ9JMA7 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cyp3a41aQ9JMA7 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cyp3a41aQ9JMA7 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cyp3a41aQ9JMA7 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cyp3a41aQ9JMA7 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cyp3a41aQ9JMA7 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cyp3a41aQ9JMA7 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cyp3a41aQ9JMA7 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cyp3a41aQ9JMA7 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cyp3a41aQ9JMA7 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cyp3a41aQ9JMA7 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cyp3a41aQ9JMA7 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cyp3a41aQ9JMA7 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cyp3a41aQ9JMA7 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cyp3a41aQ9JMA7 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cyp3a41aQ9JMA7 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cyp3a41aQ9JMA7 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cyp3a41aQ9JMA7 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cyp3a41aQ9JMA7 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Cyp3a41aQ9JMA7 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cyp3a41aQ9JMA7 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cyp3a41aQ9JMA7 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cyp3a41aQ9JMA7 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cyp3a41aQ9JMA7 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cyp3a41aQ9JMA7 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cyp3a41aQ9JMA7 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cyp3a41aQ9JMA7 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cyp3a41aQ9JMA7 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cyp3a41aQ9JMA7 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cyp3a41aQ9JMA7 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cyp3a41aQ9JMA7 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cyp3a41aQ9JMA7 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms