Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rabgef1Q9JM13 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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