Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms