Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms