Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gde1Q9JL56 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gde1Q9JL56 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gde1Q9JL56 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gde1Q9JL56 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gde1Q9JL56 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gde1Q9JL56 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gde1Q9JL56 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gde1Q9JL56 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gde1Q9JL56 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gde1Q9JL56 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gde1Q9JL56 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gde1Q9JL56 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gde1Q9JL56 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gde1Q9JL56 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gde1Q9JL56 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gde1Q9JL56 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gde1Q9JL56 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gde1Q9JL56 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gde1Q9JL56 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gde1Q9JL56 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gde1Q9JL56 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gde1Q9JL56 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gde1Q9JL56 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gde1Q9JL56 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gde1Q9JL56 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gde1Q9JL56 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gde1Q9JL56 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gde1Q9JL56 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gde1Q9JL56 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gde1Q9JL56 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gde1Q9JL56 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gde1Q9JL56 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gde1Q9JL56 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gde1Q9JL56 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gde1Q9JL56 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gde1Q9JL56 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gde1Q9JL56 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gde1Q9JL56 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gde1Q9JL56 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gde1Q9JL56 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gde1Q9JL56 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gde1Q9JL56 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gde1Q9JL56 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gde1Q9JL56 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gde1Q9JL56 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gde1Q9JL56 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gde1Q9JL56 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gde1Q9JL56 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gde1Q9JL56 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gde1Q9JL56 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gde1Q9JL56 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gde1Q9JL56 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gde1Q9JL56 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gde1Q9JL56 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gde1Q9JL56 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gde1Q9JL56 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Gde1Q9JL56 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Gde1Q9JL56 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gde1Q9JL56 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gde1Q9JL56 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gde1Q9JL56 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gde1Q9JL56 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gde1Q9JL56 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gde1Q9JL56 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gde1Q9JL56 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gde1Q9JL56 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gde1Q9JL56 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gde1Q9JL56 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gde1Q9JL56 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gde1Q9JL56 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gde1Q9JL56 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gde1Q9JL56 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gde1Q9JL56 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gde1Q9JL56 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gde1Q9JL56 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gde1Q9JL56 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gde1Q9JL56 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gde1Q9JL56 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gde1Q9JL56 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gde1Q9JL56 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gde1Q9JL56 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gde1Q9JL56 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gde1Q9JL56 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gde1Q9JL56 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gde1Q9JL56 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gde1Q9JL56 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gde1Q9JL56 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gde1Q9JL56 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gde1Q9JL56 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gde1Q9JL56 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gde1Q9JL56 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gde1Q9JL56 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gde1Q9JL56 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gde1Q9JL56 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gde1Q9JL56 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gde1Q9JL56 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gde1Q9JL56 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gde1Q9JL56 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gde1Q9JL56 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms