Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scamp5Q9JKD3 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms