Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard6bQ9JK83 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 195.4 ms