Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Cnga3Q9JJZ8 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
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