Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms