Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms