Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHW9

Aldh1a3, Aldehyde dehydrogenase family 1 member A3, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a3Q9JHW9 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aldh1a3Q9JHW9 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms