Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn12Q9ET43 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms