Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Usp29Q9ES63 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Usp29Q9ES63 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Usp29Q9ES63 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Usp29Q9ES63 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Usp29Q9ES63 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Usp29Q9ES63 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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