Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms