Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER42

Barx1, Homeobox protein BarH-like 1, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx1Q9ER42 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms