Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ16

Cxcr6, C-X-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr6Q9EQ16 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cxcr6Q9EQ16 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cxcr6Q9EQ16 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cxcr6Q9EQ16 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cxcr6Q9EQ16 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cxcr6Q9EQ16 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cxcr6Q9EQ16 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cxcr6Q9EQ16 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cxcr6Q9EQ16 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cxcr6Q9EQ16 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cxcr6Q9EQ16 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cxcr6Q9EQ16 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cxcr6Q9EQ16 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cxcr6Q9EQ16 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cxcr6Q9EQ16 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cxcr6Q9EQ16 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cxcr6Q9EQ16 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Cxcr6Q9EQ16 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cxcr6Q9EQ16 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cxcr6Q9EQ16 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cxcr6Q9EQ16 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cxcr6Q9EQ16 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cxcr6Q9EQ16 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cxcr6Q9EQ16 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cxcr6Q9EQ16 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cxcr6Q9EQ16 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cxcr6Q9EQ16 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cxcr6Q9EQ16 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cxcr6Q9EQ16 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cxcr6Q9EQ16 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cxcr6Q9EQ16 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Cxcr6Q9EQ16 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cxcr6Q9EQ16 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cxcr6Q9EQ16 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cxcr6Q9EQ16 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cxcr6Q9EQ16 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cxcr6Q9EQ16 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cxcr6Q9EQ16 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Cxcr6Q9EQ16 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cxcr6Q9EQ16 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cxcr6Q9EQ16 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cxcr6Q9EQ16 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cxcr6Q9EQ16 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cxcr6Q9EQ16 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cxcr6Q9EQ16 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Cxcr6Q9EQ16 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cxcr6Q9EQ16 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Cxcr6Q9EQ16 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cxcr6Q9EQ16 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cxcr6Q9EQ16 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cxcr6Q9EQ16 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cxcr6Q9EQ16 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cxcr6Q9EQ16 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms