Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms