Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Smg9Q9DB90 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Smg9Q9DB90 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Smg9Q9DB90 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Smg9Q9DB90 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Smg9Q9DB90 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Smg9Q9DB90 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Smg9Q9DB90 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Smg9Q9DB90 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Smg9Q9DB90 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Smg9Q9DB90 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Smg9Q9DB90 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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