Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms