Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Subh2bvQ9D9Z7 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Subh2bvQ9D9Z7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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