Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T0

Fam3a, Protein FAM3A, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam3aQ9D8T0 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam3aQ9D8T0 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam3aQ9D8T0 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam3aQ9D8T0 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam3aQ9D8T0 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam3aQ9D8T0 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam3aQ9D8T0 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam3aQ9D8T0 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam3aQ9D8T0 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam3aQ9D8T0 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam3aQ9D8T0 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam3aQ9D8T0 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam3aQ9D8T0 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam3aQ9D8T0 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam3aQ9D8T0 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam3aQ9D8T0 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam3aQ9D8T0 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam3aQ9D8T0 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam3aQ9D8T0 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam3aQ9D8T0 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam3aQ9D8T0 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam3aQ9D8T0 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam3aQ9D8T0 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam3aQ9D8T0 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam3aQ9D8T0 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam3aQ9D8T0 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam3aQ9D8T0 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam3aQ9D8T0 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam3aQ9D8T0 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam3aQ9D8T0 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam3aQ9D8T0 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam3aQ9D8T0 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam3aQ9D8T0 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam3aQ9D8T0 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam3aQ9D8T0 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam3aQ9D8T0 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam3aQ9D8T0 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam3aQ9D8T0 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam3aQ9D8T0 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam3aQ9D8T0 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam3aQ9D8T0 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam3aQ9D8T0 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam3aQ9D8T0 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam3aQ9D8T0 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam3aQ9D8T0 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam3aQ9D8T0 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam3aQ9D8T0 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam3aQ9D8T0 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam3aQ9D8T0 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam3aQ9D8T0 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam3aQ9D8T0 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam3aQ9D8T0 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam3aQ9D8T0 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam3aQ9D8T0 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fam3aQ9D8T0 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fam3aQ9D8T0 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fam3aQ9D8T0 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fam3aQ9D8T0 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam3aQ9D8T0 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam3aQ9D8T0 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam3aQ9D8T0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam3aQ9D8T0 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam3aQ9D8T0 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam3aQ9D8T0 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam3aQ9D8T0 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam3aQ9D8T0 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam3aQ9D8T0 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam3aQ9D8T0 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam3aQ9D8T0 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam3aQ9D8T0 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam3aQ9D8T0 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam3aQ9D8T0 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam3aQ9D8T0 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam3aQ9D8T0 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam3aQ9D8T0 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam3aQ9D8T0 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam3aQ9D8T0 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam3aQ9D8T0 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam3aQ9D8T0 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam3aQ9D8T0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam3aQ9D8T0 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam3aQ9D8T0 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam3aQ9D8T0 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam3aQ9D8T0 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam3aQ9D8T0 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam3aQ9D8T0 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam3aQ9D8T0 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam3aQ9D8T0 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam3aQ9D8T0 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam3aQ9D8T0 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam3aQ9D8T0 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam3aQ9D8T0 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam3aQ9D8T0 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam3aQ9D8T0 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam3aQ9D8T0 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam3aQ9D8T0 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam3aQ9D8T0 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam3aQ9D8T0 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam3aQ9D8T0 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam3aQ9D8T0 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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