Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn22Q9D7U6 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn22Q9D7U6 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn22Q9D7U6 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn22Q9D7U6 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn22Q9D7U6 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn22Q9D7U6 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn22Q9D7U6 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn22Q9D7U6 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn22Q9D7U6 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn22Q9D7U6 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn22Q9D7U6 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn22Q9D7U6 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn22Q9D7U6 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn22Q9D7U6 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn22Q9D7U6 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn22Q9D7U6 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn22Q9D7U6 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn22Q9D7U6 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn22Q9D7U6 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn22Q9D7U6 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn22Q9D7U6 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn22Q9D7U6 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn22Q9D7U6 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn22Q9D7U6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn22Q9D7U6 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn22Q9D7U6 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn22Q9D7U6 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn22Q9D7U6 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn22Q9D7U6 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn22Q9D7U6 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn22Q9D7U6 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn22Q9D7U6 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn22Q9D7U6 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn22Q9D7U6 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn22Q9D7U6 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn22Q9D7U6 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn22Q9D7U6 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn22Q9D7U6 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn22Q9D7U6 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn22Q9D7U6 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Cldn22Q9D7U6 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn22Q9D7U6 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn22Q9D7U6 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
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Cldn22Q9D7U6 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn22Q9D7U6 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn22Q9D7U6 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn22Q9D7U6 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn22Q9D7U6 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn22Q9D7U6 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn22Q9D7U6 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn22Q9D7U6 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn22Q9D7U6 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn22Q9D7U6 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn22Q9D7U6 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn22Q9D7U6 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn22Q9D7U6 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn22Q9D7U6 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn22Q9D7U6 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn22Q9D7U6 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn22Q9D7U6 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn22Q9D7U6 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn22Q9D7U6 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn22Q9D7U6 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn22Q9D7U6 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn22Q9D7U6 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Cldn22Q9D7U6 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn22Q9D7U6 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Cldn22Q9D7U6 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn22Q9D7U6 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn22Q9D7U6 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn22Q9D7U6 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn22Q9D7U6 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn22Q9D7U6 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn22Q9D7U6 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn22Q9D7U6 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn22Q9D7U6 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn22Q9D7U6 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn22Q9D7U6 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn22Q9D7U6 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn22Q9D7U6 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn22Q9D7U6 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn22Q9D7U6 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn22Q9D7U6 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn22Q9D7U6 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn22Q9D7U6 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn22Q9D7U6 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn22Q9D7U6 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn22Q9D7U6 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn22Q9D7U6 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn22Q9D7U6 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn22Q9D7U6 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn22Q9D7U6 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn22Q9D7U6 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn22Q9D7U6 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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