Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Chmp4cQ9D7F7 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms