Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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