Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms