Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S4

4930564D02Rik, RIKEN cDNA 4930564D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930564D02RikQ9D4S4 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms