Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms