Protein–RNA interactions for Protein: Q9D454

Uncharacterized protein CXorf49 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D454 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9D454 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9D454 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9D454 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9D454 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9D454 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9D454 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9D454 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9D454 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9D454 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q9D454 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q9D454 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q9D454 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q9D454 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D454 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D454 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D454 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D454 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D454 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D454 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D454 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D454 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D454 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D454 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D454 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D454 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D454 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D454 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D454 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D454 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D454 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D454 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D454 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D454 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D454 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D454 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D454 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D454 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D454 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D454 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D454 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D454 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D454 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D454 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D454 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D454 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D454 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D454 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D454 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D454 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D454 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D454 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D454 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D454 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D454 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D454 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D454 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D454 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D454 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D454 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D454 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D454 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D454 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D454 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D454 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D454 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D454 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D454 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D454 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D454 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D454 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D454 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D454 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D454 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D454 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D454 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D454 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D454 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D454 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D454 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D454 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D454 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D454 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D454 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D454 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D454 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D454 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D454 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D454 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D454 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D454 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D454 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D454 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D454 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D454 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D454 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D454 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D454 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D454 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D454 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms