Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Q9D2Q3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms