Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms