Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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