Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms