Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY94

Gins3, DNA replication complex GINS protein PSF3, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins3Q9CY94 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Gins3Q9CY94 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
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Gins3Q9CY94 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gins3Q9CY94 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gins3Q9CY94 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gins3Q9CY94 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gins3Q9CY94 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gins3Q9CY94 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gins3Q9CY94 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Gins3Q9CY94 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Gins3Q9CY94 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Gins3Q9CY94 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Gins3Q9CY94 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Gins3Q9CY94 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Gins3Q9CY94 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gins3Q9CY94 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gins3Q9CY94 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gins3Q9CY94 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gins3Q9CY94 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gins3Q9CY94 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gins3Q9CY94 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gins3Q9CY94 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gins3Q9CY94 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gins3Q9CY94 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Gins3Q9CY94 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Gins3Q9CY94 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gins3Q9CY94 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gins3Q9CY94 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gins3Q9CY94 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gins3Q9CY94 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gins3Q9CY94 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gins3Q9CY94 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gins3Q9CY94 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gins3Q9CY94 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Gins3Q9CY94 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gins3Q9CY94 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gins3Q9CY94 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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Gins3Q9CY94 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Gins3Q9CY94 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gins3Q9CY94 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Gins3Q9CY94 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gins3Q9CY94 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gins3Q9CY94 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gins3Q9CY94 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gins3Q9CY94 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gins3Q9CY94 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gins3Q9CY94 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gins3Q9CY94 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gins3Q9CY94 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gins3Q9CY94 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gins3Q9CY94 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gins3Q9CY94 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gins3Q9CY94 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gins3Q9CY94 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gins3Q9CY94 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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