Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY34

Ube2f, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, mousemouse

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fQ9CY34 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ube2fQ9CY34 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms