Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY21

Bud23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, mousemouse

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Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bud23Q9CY21 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Bud23Q9CY21 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bud23Q9CY21 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bud23Q9CY21 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bud23Q9CY21 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Bud23Q9CY21 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Bud23Q9CY21 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Bud23Q9CY21 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bud23Q9CY21 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Bud23Q9CY21 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bud23Q9CY21 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bud23Q9CY21 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bud23Q9CY21 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bud23Q9CY21 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bud23Q9CY21 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Bud23Q9CY21 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bud23Q9CY21 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bud23Q9CY21 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Bud23Q9CY21 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Bud23Q9CY21 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Bud23Q9CY21 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Bud23Q9CY21 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Bud23Q9CY21 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Bud23Q9CY21 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Bud23Q9CY21 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Bud23Q9CY21 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Bud23Q9CY21 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Bud23Q9CY21 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Bud23Q9CY21 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Bud23Q9CY21 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Bud23Q9CY21 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Bud23Q9CY21 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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Bud23Q9CY21 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Bud23Q9CY21 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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