Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tdrd12Q9CWU0 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tdrd12Q9CWU0 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tdrd12Q9CWU0 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tdrd12Q9CWU0 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tdrd12Q9CWU0 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tdrd12Q9CWU0 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tdrd12Q9CWU0 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tdrd12Q9CWU0 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tdrd12Q9CWU0 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd12Q9CWU0 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd12Q9CWU0 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd12Q9CWU0 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd12Q9CWU0 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd12Q9CWU0 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd12Q9CWU0 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd12Q9CWU0 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd12Q9CWU0 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd12Q9CWU0 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd12Q9CWU0 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd12Q9CWU0 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd12Q9CWU0 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd12Q9CWU0 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd12Q9CWU0 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd12Q9CWU0 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd12Q9CWU0 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd12Q9CWU0 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd12Q9CWU0 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd12Q9CWU0 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd12Q9CWU0 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd12Q9CWU0 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd12Q9CWU0 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd12Q9CWU0 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd12Q9CWU0 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd12Q9CWU0 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd12Q9CWU0 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd12Q9CWU0 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd12Q9CWU0 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd12Q9CWU0 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd12Q9CWU0 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd12Q9CWU0 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tdrd12Q9CWU0 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tdrd12Q9CWU0 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tdrd12Q9CWU0 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms