Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM2

Cdca4, Cell division cycle-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca4Q9CWM2 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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