Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms